在1945年大选中,工党击败保守党,在大选中取得了大胜,而威尔逊也顺利地当选国会议员。但他意想不到的是,他立即被聘任为公务部(Ministry of Works)的国会秘书。两年后,他被改派为海外贸易秘书(Secretary for Overseas Trade),任内曾数次到访苏联,商讨贸易事宜,但这些外访在日后却遭对手指为有通敌之嫌。
在1947年10月14日,年仅31岁的威尔逊被任命为贸易委员会主席(President of the Board of Trade),晋身内阁,成为20世纪英国最年轻的阁员。在任内,他大力提倡通过《1947年贸易统计学法案》,改革英国收集经济数据的法则,而该法案也一直沿用至今。另外,他还带头动议废除战时的配给制度。到了1950年大选,由于选区改易,威尔逊转到新设立的海顿(Huyton)选区,最终以些微的票数险胜。